本處隸屬於桃園市政府農業局，目前組織內編制有獸醫公衛課、獸醫行政課、獸醫防疫課、動物保護課、動物管制課、動物保護教育園區管理課、寵物及產業管理課共七個業務課，其他行政另設有收發室、人事室及會計室等。針對業務內容在升格直轄市後，擴及對動物防疫與保護之願景。
升格後持續訪查本市養豬場豬隻健康情形並辦理重要豬隻疫病採樣監測工作，輔導轄內肉品市場、屠宰場及養豬場相關區域之自主消毒防疫工作，持續推動重要豬隻疫病防治宣導工作及豬隻疫苗預防注射工作。
動物疾病檢驗之強化，目的在於協助經濟動物養殖業者檢驗動物疾病，並告知使用法定用藥，減少抗藥性菌種產生，以及建議畜主正確飼養管理維持動物健康； 畜禽產品安全衛生及畜牧場用藥品質監測之強化，目的在於養殖業者出售時家畜禽製食用動物產品前，依據相關規範進行採樣並告知正確使用法定用藥，避免藥物殘留於家畜禽製品，共同維護社會大眾食用畜禽產品安全。
本市草食動物飼養牧場種類計有乳牛、肉牛、羊、鹿、馬等；家禽牧場種類計有蛋雞、肉雞、鴨、鵝等養禽戶。相關生產皆以乳肉蛋等產品營銷，經營型態以自銷、小規模的方式經營為主，乳品皆與國內知名大型乳品公司契約生產。為北部地區具高產能之縣市區域，畜禽養殖防疫的把關為本市為國人健康安全維護重點。
當前動物保護及關懷生命觀念盛行，加以國人飼養寵物風氣日盛，動物福利和動物保護逐漸被國人重視，我們應該涵蓋所有的動物，而不是某一種具體的動物。比如動物福利，最基本的人為飼養之動物都應該有充足的飲水和食物，不應該忍受饑餓的痛苦，這是所有動物通用的，需要我們採取措施來滿足達成基本需求。本市加強動物福利觀念及動物法令宣導，俾提昇產業形象及素質，進而保障動物生存權力及消費者權益。